A APAE adota como símbolo a flor margarida – com pétalas brancas, centro amarelo-ouro, pedúnculo e duas folhas verdes, uma de cada lado, ladeado por duas mãos em perfil, na cor branca, desniveladas, uma de posição de amparo e a outra, de orientação; abaixo, partindo do centro, dois ramos de louro, com vinte e duasfolhas.
Este símbolo não pode ser modificado de forma alguma, porque está registrado no Instituto Nacional de Propriedade Industrial – INPI, sob o nº 817546189, em nome da Federação Nacional das APAEs.