O Setor da Psicologia da APAE de Ipatinga conta com a orientação de dois psicólogos. São realizados atendimentos clínicos aos alunos e suas famílias, atendimentos especializados, avaliação de novos alunos, além de trabalhar a inclusão dos alunos no mercado de trabalho, escolas e nos demais ambientes sociais.
Os atendimentos clínicos, que podem ser individuais ou em grupo, têm a duração de 30 minutos. Quando necessário os professores e familiares também são acompanhados e orientados. Já os atendimentos especializados são contemplados 12 alunos, os atendimentos são individuais numa sessão de 40 minutos. Este atendimento é baseado na metodologia do Programa TEACCH.
As avaliações para novos alunos envolvem a equipe multidisciplinar nas terças e quintas que definem através do estudo de caso a entrada dos alunos e outros encaminhamentos. O trabalho de inclusão o setor de psicologia, juntamente com os demais setores, realiza um trabalho de conscientização nas escolas, sociedade, empresas, família, entre outros.
Também são realizados trabalhos com as mães do Clube de Mãe e do Atendimento Especializado. Este trabalho é realizado semanalmente.